产品货号:
ALH072
中文名称:
组织细胞miRNA提取试剂盒
英文名称:
Tissue Cell microRNA Extraction Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒适用于快速提取各种细胞组织miRNA和其它各种小RNA。本试剂盒采用独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,强烈有机抽提去除蛋白和DNA,RNA包括微小分子RNA吸附于离心柱内特殊硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质进一步去除,最后低盐的洗脱液将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
近年来对RNA干扰和调节性小RNA的广泛研究迫切需要一种能有效提取15 -30核苷酸左右大小RNA(包括siRNA和miRNA)的试剂盒。但是传统的RNA提取方法如硅胶膜不能有效吸附回收,酚/胍抽提和乙醇沉淀并不能有效沉淀回收微小分子RNA。
- 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。
- 也不需要乙醇沉淀等容易丧失微小分子RNA的步骤。
- 快速,简捷,单个样品操作一般可在30分钟内完成。
- 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.9~2.0,基本无DNA残留,可用于RNAi,RT-PCR,Northern-blot和各种实验。
组分 | 规格 | 说明 | 保存 |
Lysis/Binding buffer | 50mL | 4℃避光 | |
70%乙醇 | 9mL | 第一次使用前加21mL无水乙醇 | 室温 |
Wash Solution 1 | 12mL | 第一次使用前加入28mL无水乙醇 | |
Wash Solution 2/3 | 10mL | 第一次使用前加入42mL无水乙醇 | |
RNase-free H2O | 10mL | ||
吸附柱RA和收集管 | 50套 | ||
microRNA吸附柱MA和收集管 | 50套 |
保存:室温,其中Lysis/Binding buffer需置于4℃避光保存,有效期6个月。
- Wash Solution 1和Wash Solution 2/3加入无水乙醇后,可以在常温保存一个月,如果要更长时间保存,请存放在4℃,但是使用前,应该先回复到室温。
- Wash Solution 2/3可能加入乙醇使用几天后出现沉淀晶体,并不影响使用,直接不吸晶体,吸上清使用就可以。
- 运输在常温下进行,不影响使用效果。
- 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
- 第一次使用前请先在70%乙醇、Wash Solution 1瓶和Wash Solution 2/3瓶中加入指定量乙醇,加入后请及时打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
- 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13000rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C或者类似离心机。
- 需要自备乙醇,氯仿,一次性注射器,研钵。
- Lysis/Binding buffer和Wash Solution 1含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
- 组织培养细胞
- 收集<107悬浮细胞到一个1.5mL离心管。(对于贴壁细胞,孔板培养和细胞瓶培养可以直接裂解,尽可能吸干净所有培养液残留后直接加入1mL的Lysis/Binding buffer,迅速轻摇使Lysis/Binding buffer充分和瓶底所有细胞接触裂解细胞并灭活RNA酶,轻轻用移液枪反复吹打混匀接操作步骤项下3。)
- 13000rpm离心10秒(或者300g离心5分钟),使细胞沉淀下来。完全吸弃上清,留下细胞团,注意不完全弃上清会稀释裂解液导致产量纯度降低。
- 轻弹管壁将细胞沉淀完全松散重悬,加入1mL Lysis/Binding buffer,涡旋或者吹打,充分裂解混匀。
- 接操作步骤项下3。
- 收集<107悬浮细胞到一个1.5mL离心管。(对于贴壁细胞,孔板培养和细胞瓶培养可以直接裂解,尽可能吸干净所有培养液残留后直接加入1mL的Lysis/Binding buffer,迅速轻摇使Lysis/Binding buffer充分和瓶底所有细胞接触裂解细胞并灭活RNA酶,轻轻用移液枪反复吹打混匀接操作步骤项下3。)
- 动物组织(例如鼠肝脑)
- 新鲜组织用解剖刀迅速切成小碎块,根据处理组织的质量,按照50~100mg加入1mL的比例加入Lysis/Binding buffer后电动或者手动彻底匀浆。或者在液氮中研磨组织成细粉后,取适量组织细粉(约50~100mg)转入装有1mL Lysis/Binding buffer的1.5mL离心管中,剧烈吹打涡旋混匀。
- 可选,一般不需要:如果处理量大,有明显颗粒或者不溶物,非常粘稠或者裂解不充分,可立即用带针头的一次性5mL(约0.9mm针头)注射器抽打裂解物10次或直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。
- 接操作步骤项下3。
- 新鲜组织用解剖刀迅速切成小碎块,根据处理组织的质量,按照50~100mg加入1mL的比例加入Lysis/Binding buffer后电动或者手动彻底匀浆。或者在液氮中研磨组织成细粉后,取适量组织细粉(约50~100mg)转入装有1mL Lysis/Binding buffer的1.5mL离心管中,剧烈吹打涡旋混匀。
- 室温放置5分钟以充分分离核酸蛋白复合物。
- 加入200μL氯仿,剧烈振荡15秒。
- 室温放置2~3分钟,13000rpm离心10分钟。
- 小心取上清(约600μL)转入到新的离心管,加入1.5倍体积的无水乙醇(必须是室温的,通常900μL),涡旋混匀。此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心,立刻接下步。
- 将混合物(每次小于700μL,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)12000rpm离心30~60秒,弃掉废液。
- 加700μL Wash Solution 1(请先检查是否已加入无水乙醇!),12000rpm离心30秒,弃掉废液。
- 加入500μL Wash Solution 2/3(请先检查是否已加入无水乙醇!),12000rpm离心30秒,弃掉废液。加入500μL Wash Solution 2/3,重复一遍。
- 将吸附柱RA放回空收集管中,13000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
- 取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30~50μL RNase-free water(事先在100℃水浴中预热效果更好),室温放置1分钟,12000rpm离心1分钟。
- 如果预期RNA产量>30μg,加30~50μL RNase-free water重复步骤11,合并两次洗脱液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。
- 洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15~30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。
- 预防RNase污染,应注意以下几方面:
- 经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。
- 使用无RNase的塑料制品和枪头避免交叉污染。
- RNA在裂解液中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料器皿可在0.5M NaOH中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。
- 配制溶液应使用无RNase的水。(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1%(v/v),37℃放置过夜,高压灭菌。)
- 经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。
- RNA纯度及浓度检测:
- 完整性:RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150V,15分钟)检测完整性。由于细胞中70%~80%的RNA为rRNA,电泳后UV下应能看到非常明显的rRNA条带。动物rRNA大小分别约为5kb和2kb,分别相当于28S和18S rRNA。动物RNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5~2.0倍,否则表示RNA样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。
- 纯度:OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数(10mM Tris,pH7.5)在1.8~2.1之间。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10mM Tris(pH7.5)中测出的OD260/OD280读数1.8~2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5~1.9之间,但这并不表示RNA不纯。
- 浓度:取一定量的RNA提取物,用RNase-free水稀释n倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260,OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/μL)= (OD260)×(稀释倍数n)×40
- 完整性:RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150V,15分钟)检测完整性。由于细胞中70%~80%的RNA为rRNA,电泳后UV下应能看到非常明显的rRNA条带。动物rRNA大小分别约为5kb和2kb,分别相当于28S和18S rRNA。动物RNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5~2.0倍,否则表示RNA样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。
- microRNA富集方法(仅仅提取microRNA,不包含>200nt其它总RNA成分)
- 不同的实验可以选择不同的方法,例如Northern Blot或者表达芯片谱分析可以选择提取包括microRNA的总RNA。富集方法提取的microRNA因为去除了较大片段的mRNA和rRNA等,可能减少某些下游试验的扩增背景,当背景较高或者非特异扩增较多时,可以尝试使用富集方法提取的microRNA。
- 按照前面标准操作步骤1~5操作,直到得到上清。
- 较精确估计上清体积(约600μL),加入等体积70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!)(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。
- 将混合物加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)12000rpm离心30~60秒,收集滤过物。将滤过物从收集管转移到一个新的离心管后,把吸附柱子放回空的收集管内,再加入剩下的混合物,离心,收集滤过物。合并两次滤过物,计算体积。
- 此时,滤过物含有microRNA,吸附柱子上面是除去了microRNA的总RNA(不包含microRNA),如果需要,可以按照前面标准操作步骤8~11操作漂洗,洗脱回收得到去除了microRNA的总RNA。
- 较精确估计滤过物体积,加入0.65倍体积无水乙醇(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。
- 取一套新的microRNA吸附柱MA,将上一步骤混合物(每次小于700μL,多可以分两次加入)加入microRNA吸附柱MA中,(吸附柱放入收集管中)12000rpm离心30秒,弃掉废液。
- 按照前面标准操作步骤8~11操作漂洗,洗脱得到富集的microRNA。
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